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Meeting agenda draft for 05/17/2017

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Photo by Jerry Harb

AGENDA

UCI Malaria Initiative meeting May 17, 10:30-3:00pm, 4248 McGaugh Hall

Anthony A. James, James Lab Staff

Ethan Bier

Gregory Lanzaro

John Marshall

Collaborator meeting UCI, UCSD, UCB

May 17, 2017

Room 4248 McGaugh Hall, UCI

10:30- 4:00PM (lunch provided)

Items

1. Introductions
2. Administrative

             a. Interactive projects

                            i. TIGS

                            ii. UCI MI (BMGF)

                            iii. DARPA UCR

                            iv. DARPA Broad/MIT

               b. Initiative website(s)

               c. Forward copies of regulatory documents as approved

               d. Lists of team members and responsibilities by UC

        3. Improvements to Plasmodium falciparum effector molecules

             a. Mosquito promoters

                           i. An. stephensi

                           ii. An. gambiae

                          III. Midgut

                                       1. G12

                                       2. Peritrophic matrix 1

                           iv.   hemolymph

                                       1.Vitellogenin

             b. Single-chain antibodies

                           i. Existing

                                         1. Pfs 25 4B7

                                         2. CSP 2A10

                                         3. Chitinase 1C3

                           ii. Synthetic

                                          1. Pfs 25

                                          2. Pfs 47

                                          3. Pfs 230

                                          4. CSP

                                          5. Chitinase

                                          6. HAP2

             c. Other effectors

                           i. Mosquito ligands (SM1)

                           ii. Antimicrobial peptides

                           iii. Atreptic immunity (FREP1)

        4. P. vivax effector molecules

             a. Catalog of target molecules

                           i. Conserved surface proteins in midgut stages of parasites

        5. Improvements to gene drive machinery

             a. Options for sex-specific drive and screening approaches

                           i. Males only

                                          1. Testes promoter searches

                                                      a. B2 tubulin

                                                      b. Phf7

                                                      c. Snail

                                                      d. Topi

                                                      e. Others

                           ii. Females only

                                          1. Female promoter searches

                                                       a. nanos

                           iii. Pipeline for analysis

                                           1. RT-PCR

                                           2. In situ hybridization

                           iv. New gene discovery

                                           1. Dissections

                                           2. RNA-seq

             b. Genomic target sites

                           i. Locus with load (kh^w)

                           ii. Neutral locus

                           iii. Positive (additional effector phenotypes [e.g.FREP1])

    6. Cas9 helper lines

             a. Vasa-Cas9 in attP80.9 fully marked

                           i. Removal of marker genes

             b. Dominant, no load visible marker gene candidates

             c. Recessive, no load visible marker genes

                           i. yellow

                           ii. ebony

                           iii. others?

    7. Options for challenge assays

             a. Plasmodium falciparum

                           i. Existing

                                          1. UCSD

                                           2. NIH

                           ii. To develop

                                           1. UCSD 

                                           2. UCI

             b. Plasmodium vivax

                           i. India

                           ii. other

    8. Modelling priorities

    9. Genome projects

             a. Domestic pipeline options

             b. Indian pipeline options

             c. Target species

                           i. Anopheles culicifacies

                           ii. An. stephensi

                           iii. An. subpictus

                           iv. An. fluviatilis

                           v. An. minimus

                           vi. An. dirus

                           vii. An. sundaicus

                           viii. An. baimaii

                           ix. Aedes aegypti

                           x.  Ae. albopictus

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